新たに出現した病原体や既知の病原体の懸念される変異株を迅速に追跡することは、次のパンデミック、エピデミックまたはアウトブレイクを食い止めるための鍵である。
各国の保健サーベイランスおよびモニタリング体制を支援し、強化するためには、世界的な協力が必要である。
オミクロン株について世界保健機関(WHO)に警告した科学者であるトゥリオ・デ・オリヴェイラ博士は、低・中所得国がゲノムサーベイランス能力を構築することを支援するため、「グローバル・ファンド」の設立を提案している。
新型コロナウイルスに関する科学的理解は、ウイルスそのものと同様に絶えず進化している。ウイルスが初めて発見されて以来、遺伝子コードの解読と共有により、病原体のゲノムがどのように進化するか、ヒトへの感染に必要なタンパク質をコードする遺伝子、そしてパンデミックを封じ込めるためのワクチンの迅速な開発について、前例のない知見が得られてきた。
世界は現在、新型コロナウイルスのオミクロン株による新たな感染拡大に直面しており、私たちは 共存する ための方法を学ぶ必要がある。こうした不確実性と、それに対する世界的な対応によって、今後のパンデミックの行方が決まるだろう。
ウイルスのゲノム配列および関連データのリポジトリは、世界中で増え続けている。2010年代半ばのエボラ出血熱の流行により、ゲノム解読の開発が加速し、政策立案者や科学者が流行を封じ込めるための適切な公衆衛生対策を実施することが可能になった。また、当時の研究は、今後の公衆衛生上の意思決定に役立つ可能性もあった。
世界的なウイルスのゲノム解析およびサーベイランスを強化するためには、新たな体制、システム、基準、またはアクセスモデルが、技術者、データシステムの専門家、臨床医、診断・治療薬の開発者の知見に基づいていることを確保する必要がある。また、地域から世界規模までの公衆衛生上の意思決定を効率化し、迅速な結果を提供できる専門家を育成することも求められる。誰がどのような条件でデータにアクセスできるのか、また結果がどのように公共の利益に資するのかという問題にも対処する必要がある。
南アフリカおよび英国は、2020年4月という早い時期に、新型コロナウイルスに対する全国的なゲノムサーベイランスの取り組みを実施した最初の主要国であった。我々は、博士トゥリオ・デ・オリヴェイラ（クワズールー・ナタール大学クワズールー・ナタール研究・イノベーション・シーケンシング・プラットフォーム（KRISP）所長）、そしてステレンボッシュ大学感染症対応・イノベーションセンター所長に話を聞いた。
国際協力がオミクロン株の検出にどのように貢献したか
デ・オリヴェイラ教授と彼のチームは、オミクロン株の存在を世界保健機関(WHO)およびその他の当局に最初に警告した科学者である。彼はハウテン州で新型コロナウイルス関連の症例が憂慮すべき増加傾向にあることに気づき、その増加の理由を明らかにするための調査を開始した。ハウテン州では、これまでデルタ株による感染の波が最も大きかった。収集された検体の異常は、サーベイランスネットワークの一員であるランセット・ラボラトリーズの科学者アリシア・ヴェルメーレンによって最初に検出された。同研究所は、変異の非常に多いウイルスの6つのゲノムを送付していた。ボツワナおよび香港からも少数ながら報告があった。
データはまもなくGISAIDにアップロードされた。GISAIDは、すべてのインフルエンザウイルスおよび新型コロナウイルスのデータの迅速な共有を促進する国際的なリポジトリである。デ・オリヴェイラ教授は、その直後にこの流行を発見し、WHOに報告した。
研究室では、ウイルスの性質および ウイルスの増殖の特徴を調べ、他のウイルス変異株のものと比較する。次に、ワクチン接種者または回復者の血液中に見られる抗体によって、ウイルスがどの程度中和されうるかを検査する。既感染者またはワクチン接種者を対象とした研究が完了するまで、オミクロン株について我々はまだ十分に理解していないが、現時点で判明しているオミクロン株に関する知見は、世界的な対応における二つの緊急の要件を示している：
ユニバーサルワクチン接種は、依然として重症の新型コロナウイルス感染症に対する最善の手段である。
すべての人々の健康と幸福を守り、促進するために、世界の保健体制を強化する必要がある。
「新たな発見を速やかかつ誠実に報告することが、流行に対して必要な世界的対応を引き起こすための最も重要な要素である」とデ・オリヴェイラ氏は述べる。「そのため、この新たな変異を認識するとすぐに、私は（南アフリカの）保健局長とWHOに連絡しました。その後も、この分野のトップクラスの科学者たちと多くの議論を重ねました。彼らは、これが小規模な集団感染なのか、それとも他の地域に広がっているのかを確認するため、複数の診療所から何百もの検体を収集していました。」
南アフリカで行われているような、適時的な保健サーベイランスと報告を世界的に再現するための協力と投資は、病原体の早期検出と流行への対応につながる可能性がある。
データのための世界的な財政支援の仕組み
デ・オリヴェイラ氏は、特に突破感染（ブレイクスルー感染）、例えばオミクロン株で見られたような感染に関して、一部の低・中所得国におけるウイルスのシーケンシング取り組みからのデータの統合を支援するための財政的仕組みとして機能する「グローバル・ファンド」の設立を提案している。
「南アフリカのように、貧困線以下で生活する人口が多く、経済が発展途上の国々は、流行に対する介入措置として渡航禁止措置が取られると、大きな打撃を受けます」と彼は述べる。「現在、産業は甚大な経済的損害に直面しており、失業率がすでに非常に高い国で、多くの人々が職を失っています。」渡航禁止措置と彼は述べる。
デ・オリヴェイラ氏は、オミクロン株の報告に伴い、南アフリカおよびその他の南部アフリカ諸国に対して課された渡航禁止措置は、他の国々がこのような発見を報告することを思いとどまらせる可能性があると感じていると述べた。しかし、低・中所得国に対する正式な世界的財政支援の仕組みがあれば、これらの国々が病原体や世界的に懸念される変異株の特定をより迅速かつ透明に行うようになるだろう。
ゲノムデータの適時かつ透明な共有は、将来のパンデミックを回避するために極めて重要であり、そのためにも、世界的に懸念される情報を特定して共有する国々に補償を行うシステムが必要である。
トゥリオ・デ・オリヴェイラ、ゲノムサーベイランスネットワーク、南アフリカ
「科学者としての我々の役割は、そのようなリスクから世界を守ることであり、科学者や政府が三、四週間沈黙を選ぶような事態を招いてはなりません」と彼は述べる。「ゲノムデータの適時かつ透明な共有は、将来のパンデミックを回避するために極めて重要であり、そのためにも、世界的に懸念される情報を特定して共有する国々に補償を行うシステムが必要です。
デ・オリヴェイラ氏はまた、ユニバーサルワクチン接種の緊急性を強調し、各国政府に対して、COVAXへの約束を果たすよう促している。これこそが、世界の保健分野における協力への信頼を再構築し、将来的な新型コロナウイルスの流行とそれに伴う経済的損害を抑制する唯一の方法である、と彼は述べる。
病原体検出のための世界戦略
2021年5月、WHO加盟国は決議74.7を採択し、ゲノムシーケンシングなどの検査技術を通じて新たな脅威を検出する能力を高めるよう各国に求めた。新型コロナウイルス感染症の感染拡大の波が続く中、パンデミックや流行を引き起こす可能性のある病原体のゲノムサーベイランスと、リアルタイムでの追跡を強化することが世界的に急務となっている。
病原体のシーケンシングとバイオインフォマティクスを分野横断的に強化する必要性と世界的な機運を踏まえ、WHOは世界戦略の策定を調整している。この戦略は、地域から世界規模に至るまで、質が高く適時的かつ適切な公衆衛生対策のためにゲノムサーベイランスを強化し、拡大することを目指す高次のビジョンを提供することを目的としている。
WHOのテドロス・アダノム・ゲブレイェスス事務局長は、世界の保健体制を強化するための法的拘束力のある条約の締結を提唱している。WHO加盟国は政府間交渉機関の設置を進めており、国際協定に関する交渉を開始する予定である。これは、将来のパンデミックに対してよりー貫性があり公平な対応を実現するためである。
